พล.อ.ประยุทธ์ จันทร์โอชา นายกรัฐมนตรี กล่าวถึงกรณีที่กรมสอบสวนคดีพิเศษบุกค้นวัดพระธรรมกายว่า ขณะนี้เจ้าหน้าที่กำลังดำเนินการตามกฎหมายอยู่ ส่วนกรณีที่ลูกศิษย์และพระสงฆ์ยังคงขัดขวางการทำงานของเจ้าหน้าที่ โดยไม่สนคำสั่ง ม.44 ที่ประกาศใช้ พล.อ.ประยุทธ์ กล่าวว่าเจ้าหน้าที่ต้องไปบอกพระเหล่านั้นว่า กฎหมายตามคำสั่งมาตรา 44 สามารถใช้ได้ทุกที่ ไม่ใช่จะมายกเว้นพระสงฆ์คำสั่งมาตรา 44 ประกาศใช้เพื่อให้เจ้าหน้าที่เข้าไปทำงานได้ เพราะไม่เช่นนั้นจะเกิดปัญหาหากเข้าไปโดยไม่มีอะไรคุ้มครองเจ้าหน้าที่ก็จะเดือดร้อน อีกทั้งเห็นภาพที่ออกมาเจ้าหน้าที่ไม่ได้ใช้ความรุนแรงอะไรเลย ในทางกลับกันพระสงฆ์ควรปฏิบัติในหน้าที่ของสงฆ์ รัฐบาลมีหน้าที่รักษาความสงบเรียบร้อยให้ทุกคนปฏิบัติตามกฎหมาย เจ้าหน้าที่ต้องได้รับการคุ้มครองในกรณีที่ทำโดยสุจริต ทุกคนส่วนใหญ่ก็เป็นชาวพุทธ นับถือศาสนาพุทธกันอยู่แล้ว ใครอยากจะไปทำร้าย ทำลายพระสงฆ์ ทำลายพุทธศาสนา
อย่างไรก็ตาม พล.อ.ประยุทธ์ ยังได้กล่าวอีกว่า การใช้คำสั่ง ม.44 บุกค้นวัดเป็นการให้อำนาจกับเจ้าหน้าที่ ซึ่งถือเป็นอำนาจปกติเพียงแต่ให้สามารถเข้าไปในพื้นที่ให้ได้ และคุ้มครองเจ้าหน้าที่ก็แค่นั้น แต่การจับกุมดำเนินคดีก็เป็นเรื่องของกฎหมาย ซึ่งเจ้าหน้าที่ตำรวจเขาต้องจับกุมอยู่แล้ว เจอผู้ร้ายจะไม่จับได้อย่างไร