พระสนิทวงศ์ วุฒิวังโส ผู้อำนวยการสำนักสื่อสารองค์กรวัดพระธรรมกาย ได้ออกมาชี้แจงพร้อมยืนยันว่า วัดพระธรรมกายไม่ได้เป็นเอกเทศ หรือปกครองตัวเองตามที่เป็นข่าว และได้ให้ความร่วมมือกับทางเจ้าหน้าที่ในการตรวจค้นทุกส่วนของวัดด้วยดี แม้จะมี มาตรา 44 ซึ่งทางวัดไม่เห็นด้วย เพราะไม่ได้รับความชอบธรรม
ด้านคดีความขณะนี้ทางวัดมีข้อกล่าวหา 3 หมายจับ 308 คดี ถูกยึด 6ประตู 15 อาคาร และเจ้าหน้าที่มีการลาดตระเวนพื้นที่ 2,000 ไร่ แสดงให้เห็นว่าทางวัดอยู่ภายใต้กฎหมาย โดยเจ้าหน้าที่ได้ตรวจค้นทุกพื้นที่แล้ว แต่ไม่พบพระธัมมชโย ซึ่งได้มีการเซ็นเอกสารรับองว่าไม่มีสิ่งผิดกฎหมายแล้ว
ส่วนกรณีที่ดีเอสไอ มีมาตรการคัดแยกคนและพระออกจากวัด รวมทั้งที่ประกาศให้พระ 14 รูปไปรายงานตัว ยืนยันว่าพระทั้ง 14 รูปเข้าใจสถานการณ์ดี และบางส่วนได้เข้าไปพบเจ้าหน้าที่แล้ว ยกเว้นพระธัมมมชโย และพระที่อาพาธหนัก ส่วนตนเองอยากไปพบเจ้าหน้าที่แต่ญาติโยมห้ามไว้ เพราะเกรงว่าจะไม่ได้รับการปล่อยตัว
สำหรับ คำสั่งตามมาตรา 44 ในการควบคุมพื้นที่ ทางวัดรู้สึกว่าถูกคุกคาม โดยเฉพาะกรณีปรากฎภาพเจ้าหน้าที่สวมเครื่องแบบและถือวัตถุต้องสงสัยคล้ายระเบิด ทำให้ทางวัดตื่นตระหนก และเกิดความไม่สบายใจ ขอให้หยุดการใช้เฮลิคอปเตอร์บินสำรวจพื้นที่ในระดับต่ำ ส่วนเหตุการณ์ปะทะเมื่อช่วงเช้ามีศิษย์วัดพระธรรมกายบาดเจ็บ 7 ราย ทั้งบาดเจ็บสาหัสกระดูกซี่โครงหัก ไหปลาร้าหัก และมีผู้อาการคล้ายถูกไฟฟ้าซ็อต ด้วยเครื่องช็อตไฟฟ้าบริเวณหน้าอกด้วย
